Вполне возможно, что животные на фермах и сейчас получают также много антибиотиков в некоторых целях. В дополнение к широкому применению в терапии большое количество антибиотиков используется в профилактических целях.
Для промышленного животноводства важно, чтобы профилактическое применение антибиотиков предотвращало риск возникновения заболеваний. Такое применение антибиотиков увеличивает резервуар резистентных микроорганизмов точно так же, как это-происходит при применении их для стимуляции роста. Профилактическое применение сульфонамидов для предотвращения кокцидиозов является основной причиной большого количества резистентных к этим химиотерапевтическим веществам штаммов Е. coli среди птицы [40]. Для стимуляции роста с успехом применяют синтетические препараты, которые не способствуют возникновению резистентности к антибиотикам [57]. По-видимому, аналогичные препараты следует разработать и для целей профилактики.